应用SELDI技术建立尿毒症患者筛选血清蛋白质指纹图谱模型

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发表于 2020-7-3 04:16:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
【中图分类号】R44 .1 【文献标识码】A 【文章编号】1 12-3183(2011)12-0030-01   【摘要】目的:建立尿毒症患者筛选血清蛋白质指纹图谱模型。方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及CM10蛋白芯片获得尿毒症患者和健康者血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立尿毒症的筛选模型。结果:尿毒症患者与健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有5个标志蛋白( 94 Da,  543Da, 11143Da,  01 Da,  149Da)在尿毒症患者血清中高表达,1个标志蛋白(8103Da)在尿毒症患者血清中低表达。SELDI-TOF-MS技术的特异性(38/40,95%),敏感度(3 /40, 90%). 分析系统筛选出 543Da、 01 Da、8103Da、11143Da标志蛋白建立尿毒症的诊断模型。结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分尿毒症患者与健康者, SELDI-TOF-MS在尿毒症的诊断及特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值。   【关健词】表面增强激光解析电离飞行时间质谱; 蛋白芯片; 尿毒症    尿毒症是肾功能衰竭的最严重阶段,病情严重,死亡率高。在我国的发病率每年每百万人口中新发生的尿毒症患者约占1%,其中80%为青壮年,严重影响了人们的健康和生命安全。肾衰早期,往往雅临床症状,而仅表现为基础疾病的症状,因此早期发现、早期治疗是预防进入尿毒症期的最有效方法。我们利用美国Ciphergen 公司生产的表面增强激光解吸离子化时间飞行质谱(surface enhanced laser desorption/ionization)技术对尿毒症患者和健康志愿者血清中的蛋白质进行对比分析, 采用生物信息学方法建立可作为尿毒症诊断标志的蛋白质组合样式, 寻求可用于临床尿毒症早期诊断的特异性生物标记物。   1 材料与方法   1.1 材料 所有尿毒症患者血清样品均为2004-08至200 -0 台州市立医院的门、住院患者, 40例, 其中男30例, 年龄35- 0岁, 女10例, 年龄45- 4岁, 符合尿毒症诊断标准[1],对照样品来自经健康查体正常的志愿者40例, 其中男30例, 年龄40- 8岁; 女10例, 年龄40- 5岁。在10 ml血清分离管中全血采集,于-4℃ 4000 r/min离心10 min. 取30 μl血清分装在0.5 ml离心管中, 于-10℃冰箱保存. 美国赛弗吉公司的表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(Surface Enhanced Laser Desorption Ionization-time OF Flight-Mass Spectrometry, SELDI-TOF-MS)及该公司配套CM10(弱阳离子交换)芯片. 主要试剂: 尿素、乙腈、三氟乙酸等均购自Sigma公司, SPA(Sinapinic Acid) 购自Ciphergen Biosystems公司. U9缓冲液(9 mol/L Urea, 20 g/L CHAPS, 10 g/L DTT, 50 mmol/L Tris-HCl, pH 9.0 ), U1缓冲液(用50 mmol/L Tris-HCl缓冲液9倍稀释U9缓冲液), CM10缓冲液(100 mmol/L 乙酸钠pH4.0)。      1.2 方法 血清经冰浴融化后4℃20000r/min离心10min.取20μl血清,加30μl U9缓冲液,4℃振摇20min,再加100μl U1缓冲液,4℃震荡30min.每个芯池中加150μl CM10缓冲液,振荡孵育5min 2次.从上述蛋白变性后的血清样品中取50μl,加200μl CM10缓冲液稀释,加至CM10芯片的Bioprocessor中,振荡 0min,甩去血清标本,每孔加150μl CM10缓冲液,振荡孵育5min 2次,最后芯片用20mmol/L HEPES(Ph1.4)淋洗,晾干芯片.芯片每孔分2次加SPA 0.5μl,两次之间自然晾干。质谱仪参数设定为激光强度220,灵敏度1,优化范围800-20000质荷比(m/z)。每条芯片取1点用同一正常人血清作内参照,芯片间CV≤10%.检测前用ALL-IN-ONE多肽标准芯片校正,系统质量偏差≤0.1%.原始数据先以Proteinchip 3.0软件校正。    统计学处理 采用Ciphergen ProteinChip软件和BioMarker Wizard软件对芯片检测得到的蛋白质相对含量及蛋白质质荷比数据按数据挖掘要求进行处理,用Biomarker Wizard Software3.1软件和Biomarker Patterns Software4.0.1软件对数据进行分组及相关性分析,比较两组之间蛋白质峰强度时, P





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发表于 2020-7-3 04:17:38 | 显示全部楼层
谢谢雅宝题库交流网,可以欣赏到这么多的好论文
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